原核細胞含有細胞壁（支原體除外），原核細胞沒有核仁，只有擬核。進化地位較低。細胞器只有核糖體，有細胞膜，成分與真核細胞不同。細胞較小，沒有成型的細胞核，沒有染色體，DNA不與蛋白質結合。

原核細胞基本結構

原核生物的基因結構多數以操縱子形式存在，即完成同類功能的多個基因聚集在一起，處于同一個啟動子的調控之下，下游同時具有一個終止子。兩個基因之間存在長度不等的間隔序列，如與乳糖代謝有關酶的基因。在距轉錄起始點-35和-10（轉錄起始點上游的核苷酸序列為“-”，下游的核苷酸序列為“+”）附近的序列都有RNA聚合酶識別的信號。RNA聚合酶先與-35附近的序列（稱為Pribnow框）結合，然后才與-10附近的序列（稱為Sextama框）結合。RNA聚合酶一旦與-10附近序列結合，就立即從識別位點上脫離下來，DNA雙鏈解開，轉錄開始。除啟動子外，往往還有一些調控轉錄的其他因子，如調節基因和操縱基因。

原核生物基因轉錄終止之前同樣有一段回文序列結構，稱為終止子，它的特殊的堿基排列順序能夠阻礙RNA聚合酶的移動，并使其從DNA模板鏈上脫離下來。

相比真核細胞，原核細胞也有編碼區與非編碼區，但無內含子，僅有外顯子。

原核細胞生物種類

細菌

是在自然界分布最廣、個體數量最多的有機體，是大自然物質循環的主要參與者。細菌主要由細胞壁、細胞膜、細胞質、核質體等部分組成，有的細菌還有莢膜、鞭毛、菌毛等特殊結構。絕大多數細菌的直徑大小在0.5-5微米之間。可根據形狀分成三類：球菌、桿菌和螺旋菌。

放線菌微米

放線菌是具有菌絲、以孢子進行繁殖、革蘭氏染色陽性的一類原核微生物。因其具有分枝狀菌絲、菌落形態與霉菌相似，過去曾認為放線菌是"介于細菌與真菌之間的微生物"。然而，用近代生物學技術所進行的研究結果表明，放線菌實際上是屬于細菌范疇內的原核微生物，只不過其細胞形態為分枝狀菌絲。從系統發育上看，放線菌（除高溫放線菌外）與全部G+細菌一起同屬于這一大分支中的高G+C/mol%群。