東南大學(xué)有四個王牌專業(yè)，分別是：建筑學(xué)、土木工程、交通運輸專業(yè)、生物醫(yī)學(xué)工程。

東南大學(xué)四大王牌專業(yè)

建筑學(xué)：

建筑學(xué)是東南大學(xué)歷史最悠久，舉世矚目的一個王牌專業(yè)，東南大學(xué)的建筑系，是我國成立最早的建筑系，國內(nèi)建筑方面的國家級重點學(xué)科，東大占據(jù)了30%以上。

東南大學(xué)的“建筑學(xué)”，入選了國家“世界一流學(xué)科”建設(shè)名單，全國學(xué)科評估A+類的學(xué)科，國家重點學(xué)科，國家級特色專業(yè)建設(shè)點等榮譽。是我國建筑類人才培養(yǎng)的“黃埔軍校”，頂尖王牌，實至名歸。

生物醫(yī)學(xué)工程：

這個專業(yè)是東南大學(xué)依托傳統(tǒng)優(yōu)勢學(xué)科去發(fā)展交叉學(xué)科與邊緣學(xué)科的一次成功的創(chuàng)新，也是東南大學(xué)獲評A+類的5個學(xué)科之一，5個國家級重點學(xué)科之一，從“中國最好學(xué)科排名”來看，東南大學(xué)的生物醫(yī)學(xué)工程，實力排在全國前三。

土木工程：

東南大學(xué)土木工程，同樣是獲評了A+學(xué)科的專業(yè)，在上一輪教育部專業(yè)評估中排名第二，僅次于同濟。雖然，現(xiàn)在對于大學(xué)生就業(yè)而言，已不是土木專業(yè)的黃金時期，但是東南大學(xué)的土木工程專業(yè)，卻是每年高考志愿的香餑餑。原因主要還是學(xué)校專業(yè)建設(shè)的實力享譽世界，走出去的學(xué)生也能經(jīng)得起市場的考驗。

交通運輸專業(yè)：

國家一級重點學(xué)科，第三輪、第四輪全國學(xué)科評估中的評估結(jié)果為A+學(xué)科，多次蟬聯(lián)第一，也是屬于東南大學(xué)的金字招牌，科研實力非常厲害，東南大學(xué)以高速公路起家，在交通、土木方面的專業(yè)底蘊很足。